Program Studi Ilmu Al-Qur’an dan Tafsir (IAT) STIQ Wali Songo Situbondo tidak hanya mengacu pada kurikulum berbasis KKNI yang komprehensif dan kontekstual, tetapi juga telah memperoleh pengakuan resmi dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) dengan predikat Akreditasi Baik (Link Sertifikat). Pencapaian ini menjadi bukti bahwa mutu penyelenggaraan pendidikan di Prodi IAT telah memenuhi standar nasional, baik dari segi tata kelola, proses pembelajaran, maupun capaian lulusan. Akreditasi ini semakin menguatkan legitimasi STIQ dalam menjalankan visi menjadi pusat unggulan studi Al-Qur’an dan Tafsir yang berakar pada nilai-nilai kepesantrenan dan berorientasi pada kemajuan keilmuan dan kemaslahatan umat.
STIQ Wali Songo Situbondo menyelenggarakan proses pendidikan secara konsisten dengan mengacu pada kurikulum Program Studi Ilmu Al-Qur’an dan Tafsir (Link Kurikulum)yang telah disusun berbasis Kerangka Kualifikasi Nasional Indonesia (KKNI) dan disesuaikan dengan visi kelembagaan, yakni mewujudkan keunggulan dalam studi Al-Qur’an dengan prinsip Hilman, Ilman, Yaqinan, dan Islaman. Kurikulum ini dirancang secara filosofis, sosiologis, dan yuridis dengan memperhatikan dinamika keilmuan, kebutuhan masyarakat, serta regulasi nasional, dan mengintegrasikan pembelajaran, penelitian, dan pengabdian masyarakat. Dengan struktur capaian pembelajaran yang mencakup sikap, pengetahuan, keterampilan umum, dan keterampilan khusus, serta kompetensi lulusan yang relevan seperti mufassir pemula, pengajar Al-Qur’an, dan peneliti, STIQ memastikan bahwa seluruh aktivitas akademik dan pengembangan keilmuan mahasiswa dilaksanakan sesuai dengan arah dan kerangka kurikulum tersebut.